برمجيات مساعدة للباحث في تنظيم وإدارة المراجع 

توفر هذه الأداة المجانية إمكانيات متقدمة في جمع و تنظيم و إدارة المراجع الخاصة بك، ويعتبر زوتيرو الأداة الوحيدة التي بإمكانها استشعار المحتوى خلال تصفحك للإنترنت و قراءة الأوراق العلمية أو حتى المواقع الإلكترونية العادية، فتقوم هذه الأداة بتجميع البيانات اللازمة عن المحتوى و حفظ نسخة كاملة من المستند بمكتبك الخاصة على حاسبك الآلي ، كما يمكنك التسجيل بموقعهم لاستخدام المستودع الإلكتروني فيتم حفظ نسخة من مكتبك الخاصة بمستودعهم مما يجعل الرجوع إلى أي مستند منها أمر سهلا المنال بأي مكان، كما يمكنك مشاركة مكتبك الخاصة لأحد من زملائك يستخدم ذات المنصة.

مينديلي هو أحد برامج إدارة المراجع المجانية حيث يقوم بتجميع كل المراجع التي يقوم الباحث باختيارها في مكان مستودع واحد على الإنترنت، كما يسمح لك بإضافة ملاحظاتك و تعليقاتك الخاصة على المستندات، يمكنك بعدها من تصدير قائمة للمراجع حسب احتياجك إلى أي نوع من المستندات و بأي صيغة معتمدة، كما يمكنك مشاركة مكتبك الخاصة لأحد من زملائك يستخدم ذات المنصة.

يعتبر إيفرنوت من أشهر الأدوات في تدوين الملاحظات و الاحتفاظ بالقصاصات، سواء أكانت تلك ملاحظات خاصة أو أفكار مقالات و صفحات نالت إعجابك خلال تصفحك الإنترنت، أي أنه يمكنك الاحتفاظ بما تشاء على حساب خاص بك بمستودعهم على الإنترنت و يمكنك الرجوع إليه بأي مكان و من خلال أي نظام، يمكنك من تجميع هذه المعلومات في مجلدات أو وضع أوسمة مميزة تجمع المتشابه منها سويا ليسهل على الباحث العثور على المعلومة بسرعة و فعالية، كما يمكنك ربط القصاصات من خلال روابط إلكترونية تسمح لك بالتنقل فيما بينها، يفتقد إيفرنوت إلى إمكانية تصدير المراجع إلا أنه يمكنك من تخزين أي نوع من المحتويات الصوتية و المرئية و النصية.